《新世纪福音战士》电影版第1部。分为“篇（死亡篇）”与“篇（新生篇）”两个部分。“死亡篇”以原版动画第1集到第24集的内容为基础，重新剪辑了一个总结篇。“新生篇”内容承接第24集内容eee　　第十七使徒被消灭后，向下达命令，要初号机负责执行“人类补完计划”。然而碇元度不认同的做法，拒绝执行。认定这是一种叛变的行为，决定把彻底消灭。　　破晓时分，本部突然遭到来自战略自卫队的袭击，他们对的人员进行了惨无人道的大屠杀。为了保护驾驶员，葛城美里命令把精神崩溃的明日香送上二号机，并放在湖底的深处，自已就亲自去救碇真嗣。但此时的碇真嗣已经处在精神崩溃的边缘。